Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms