Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Pax8Q00288 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms