Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou2f2Q00196 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f2Q00196 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms