Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms