Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfcP97953 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfcP97953 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms