Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Brca2P97929 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Brca2P97929 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brca2P97929 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Brca2P97929 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Brca2P97929 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Brca2P97929 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Brca2P97929 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Brca2P97929 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Brca2P97929 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Brca2P97929 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms