Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AlkP97793 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AlkP97793 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AlkP97793 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AlkP97793 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AlkP97793 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AlkP97793 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AlkP97793 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AlkP97793 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AlkP97793 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AlkP97793 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms