Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cited1P97769 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cited1P97769 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cited1P97769 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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