Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
rp9P97762 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
rp9P97762 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
rp9P97762 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
rp9P97762 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
rp9P97762 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
rp9P97762 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
rp9P97762 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
rp9P97762 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
rp9P97762 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
rp9P97762 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
rp9P97762 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
rp9P97762 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
rp9P97762 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
rp9P97762 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
rp9P97762 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
rp9P97762 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms