Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms