Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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