Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubg1P83887 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubg1P83887 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubg1P83887 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubg1P83887 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tubg1P83887 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubg1P83887 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms