Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms