Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp9xP70398 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp9xP70398 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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