Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms