Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms