Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sumo1P63166 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo1P63166 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms