Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabrb2P63137 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabrb2P63137 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms