Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtnP63089 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtnP63089 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtnP63089 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms