Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms