Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms