Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms