Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpd1P62315 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms