Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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