Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga11P61622 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms