Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc5P61460 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms