Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms