Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rin3P59729 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms