Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms