Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms