Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpdl3bP58242 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms