Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms