Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mc4rP56450 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mc4rP56450 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms