Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gp1bbP56400 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms