Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms