Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtskP55097 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtskP55097 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtskP55097 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtskP55097 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms