Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacnb3P54285 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms