Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PctpP53808 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PctpP53808 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PctpP53808 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PctpP53808 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PctpP53808 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PctpP53808 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms