Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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