Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Map3k1P53349 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms