Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox5P52651 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms