Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms