Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccr5P51682 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccr5P51682 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr5P51682 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr5P51682 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr5P51682 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr5P51682 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms