Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms