Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr3P51678 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms