Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CntfP51642 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CntfP51642 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CntfP51642 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CntfP51642 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms