Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms