Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx3P50481 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms