Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csrp3P50462 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csrp3P50462 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms