Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms